小檗碱甲氧苄啶胶囊为抗感染类药，用于敏感菌所致的胃肠炎、细菌性痢疾等肠道感染。患者应该注意以下几点：
1、和医生就个人和家族疾病史、过敏史、用药情况沟通之后，在医生的指导下排除用药禁忌，用药前应仔细阅读说明书，学习和了解药物的不良反应等，避免出现严重用药风险。
2、由于本品中的甲氧苄啶可穿过胎盘屏障，在胎儿循环及羊水中血药浓度接近母体血药浓度，因此妊娠期女性应该在医生的指导下，权衡利弊后再决定是否服用本品。
3、本品中的甲氧苄啶可从乳汁排出，其血药浓度较高，有可能干扰哺乳婴儿的叶酸代谢，哺乳期女性应该谨慎服用本品。
4、本品可引起溶血性贫血，导致黄疸，患者应该谨慎服用。
5、在服用本品期间应定期去医院注意血象检查，尤其是疗程长、服用剂量大、老年、营养不良，以及服用抗癫痫药的患者。
6、用药期间注意监测药物不良反应，任何严重、持续或进展性情况均须及时与医生沟通。