高位肛瘘通常能治好，但因其病变部位较高，内口的位置并不确定，而且可能存在一定的支管，涉及到较多的肛门括约肌组织，所以治疗难度较大，存在一定的复发率。高位肛瘘指的是瘘管及其支管在肛提肌，或者肛管直肠环以上部位通过的肛瘘。
高位肛瘘通常不能直接通过简单的切开或切除术治疗，否则会对周围括约肌造成较大损伤，引起术后肛门失禁等并发症。而是往往采取挂线疗法、滑动性黏膜瓣推进关闭内口术、肛瘘管置换术等较为复杂的手术方式，且可能需要多次手术来处理病变。由于术前检查很难完全明确具体的瘘管走向，所以手术可能会没有彻底清除支管，导致感染残留，继而引起高位肛瘘复发。
总的来说，高位肛瘘在接受适当的治疗后，大多数患者可以得到有效控制和治愈。其中，选择合适的手术方法对于治疗效果至关重要。术后，患者需要按照医生的建议进行恢复和康复，以降低复发的风险。此外，保持良好的生活习惯，比如保持肛门清洁、饮食均衡、预防便秘等，也有助于减少肛瘘的复发。