肛乳头瘤手术后可能会复发，可能因手术不彻底，或病因持续存在所致。
1、手术不彻底：肛乳头瘤手术主要为切除术或结扎术。若切除术切除不彻底，或结扎术结扎位置过高，保留了过多瘤体组织，或结扎线在术后滑脱，乳头瘤未完全坏死，都可能导致复发。残留的乳头瘤组织受到手术刺激，会再次增生，形成肛乳头瘤。这种情况通常会在术后复查时发现，患者可能需要进行多次手术以彻底清除病变。
2、病因持续存在：若手术完全切除了病变瘤体，肛乳头瘤不会在此处复发。但只要造成肛乳头瘤的病因还存在，比如肛裂、肛瘘、溃疡性直肠炎等疾病尚未痊愈，就可以继续刺激其他肛乳头，使其发生增生肥大，最终在其他部位形成新的肛乳头瘤。
综上，由于肛乳头瘤存在一定的复发可能，在治疗时除手术切除肿瘤外，还需要根除病因。患者在术后应遵医嘱继续相关治疗，按时复查，及时发现复发迹象并采取相应的治疗处理。