在临床上，主要通过减少可能病因的方法，从而防止肛门狭窄的发生。常用方法包括生活方式调理、积极治疗肛肠疾病、做好术后护理和随访等。
1、生活方式调理：例如保持健康的饮食习惯、适当增加水和膳食纤维摄入（如蔬菜、水果、燕麦等）、养成规律的排便习惯、避免憋便、适当进行运动、注意保持肛门周围清洁干燥等，通过降低便秘、痔疮、肛裂、肛周脓肿等肛肠疾病的发生风险，从而达到防止肛门狭窄产生的目的。
2、积极治疗肛肠疾病：对于出现排便困难、疼痛、出血的患者，应及时到正规医院就诊，并尽快接受正规治疗，从而减少肛门损伤，进而达到防止肛门狭窄产生的目的。例如便秘严重者，可以遵医嘱使用缓泻剂、润滑剂，可以避免过度用力、减少肛门损伤；痔疮者，应遵医嘱进行恰当的药物及手术治疗，以免因治疗不当而引起肛门损伤等。
3、做好术后护理和随访：如果已经进行了肛门手术，患者应注意保证创口清洁干燥，并保持大便成形、通畅，避免出现稀便及水样便等。同时，应遵医嘱定期进行复查，必要时，可以由专科医生进行指法或器械扩肛治疗，从而防止发生肛门狭窄的情况。
值得注意的是，对于先天发育畸形和肿瘤所导致的肛门狭窄，通常难以有效预防。而及时发现并有效治疗肿瘤疾病，可能有助于预防肛门狭窄的发生。