肛门湿疹一般指肛周湿疹，患者可以根据自身病情和医院科室设置到皮肤科、肛肠外科、普通外科、中医科等科室就诊。
1、皮肤科：由于肛周湿疹是一种发生于肛门周围皮肤的炎性疾病，主要表现为肛周皮肤反复出现红肿、丘疹、丘疱疹、糜烂、渗出，并伴有剧烈瘙痒等症状。因此，患者可以到皮肤就诊，由专科医生明确诊断，并根据病情制定相应的治疗方案。
2、肛肠外科：由于肛周湿疹的发生，可能与多种肛肠疾病有关。例如痔疮、直肠脱垂、肛瘘、肛管上皮缺损、肛门失禁等疾病，均可引起分泌物增多，从而刺激肛门周围的皮肤，进而导致肛周湿疹的发生。因此，患者可以到肛肠外科就诊，由专科医生明确诊断及病因，通过积极治疗原发的肛肠疾病，从而缓解肛周湿疹的症状。
3、其他：如果就诊医院科室划分不细，没有肛肠外科时，患者可以到普通外科就诊。若希望寻求中医治疗者，也可以到中医科就诊。
值得注意的是，肛周湿疹病因复杂、症状多样，如果不及时进行规范治疗，可能会对患者的日常生活和身心健康造成影响。因此，建议患者及时到正规医院的相关科室就诊，在专科医生指导下进行诊断和治疗。