肛周脓肿需要做手术。一方面是因为肛周脓肿病情进展快，另一方面是因为单纯的保守治疗无法完全治愈疾病。
1、病情进展快：肛周脓肿是直肠肛管周围软组织或其周围间隙的急性化脓性感染，该病不会自愈。若不及时清除原有感染灶，脓肿会迅速增大并向四周扩散，继而引起多发脓肿，并可能出现肛瘘、脓毒症等并发症，治疗难度增大，对患者的健康危害也增大。
2、保守治疗不彻底：保守治疗主要是使用抗生素控制炎症。在脓肿早期，药物治疗可以缓解症状，使脓肿不至于破溃，但其对内部组织的损伤依旧存在，可能在肛门处形成内盲瘘，当患者体质较弱时，会再次形成脓肿或肛瘘，还是需要进行手术治疗。而在脓肿晚期，保守治疗已不能控制炎症，且很可能依旧形成肛瘘，必须进行手术，否则肛瘘会有癌变倾向。
所以肛周脓肿必须进行手术治疗，而且应尽可能早地进行。临床上患者一经确诊后，就会立即进行脓肿切开引流术，以控制感染，预防扩散和其他并发症。经积极治疗后，绝大多数患者可以得到痊愈。