脑蛋白水解物有多种剂型，如供口服的片剂、口服液，供注射用的注射剂，无论是哪种剂型，脑蛋白水解物均为处方药，需要在医生指导下使用，具体患者一次吃几片/喝几支，还是注射多少量、用药频次、用药疗程等，都应听医生的。因为每个患者的体质、病情以及对药物耐受程度都不相同，所以医生给每个患者的用药方案也不尽相同。切忌自行调整用药方案或者盲目使用他人的用药方案。
脑蛋白水解物能够改善失眠、头痛、记忆力下降、头昏及烦躁等症状。目前在临床上，本品主要用于促进脑外伤后遗症、脑血管疾病后遗症、脑炎后遗症、急性脑梗塞和急性脑外伤的康复。在专业医生的指导下，脑蛋白水解物也可治疗新生儿缺氧缺血性脑病，可有效控制炎症反应，改善患儿的行为神经恢复及预后效果。