脑蛋白水解物的口服制剂如脑蛋白水解物片、脑蛋白水解物口服液服用稍过量，患者可能出现精神兴奋或紧张，一般停药症状即可消失；若患者服用的量较大，则应及时催吐，并及时就医处理。脑蛋白水解物的注射剂应由医护人员使用，患者请勿自行使用，本品的注射液尚未有药物使用过量的研究。患者应严格遵医嘱用药，以免出现严重用药风险。
脑蛋白水解物能够改善失眠、头痛、记忆力下降、头昏及烦躁等症状。目前在临床上，本品主要用于促进脑外伤后遗症、脑血管疾病后遗症、脑炎后遗症、急性脑梗塞和急性脑外伤的康复。在专业医生的指导下，脑蛋白水解物也可治疗新生儿缺氧缺血性脑病，可有效控制炎症反应，改善患儿的行为神经恢复及预后效果。