五子衍宗丸和金匮肾气丸是不同的中药方剂，二者的功效作用、适应证是不同的，所以不能单纯说选哪个好。
五子衍宗丸由枸杞子、菟丝子、覆盆子、五味子、车前子组成，具有补肾益精的功效，适用于肾虚精亏所致的阳痿、遗精、早泄、腰痛、尿后余沥以及男性不育症等。而金匮肾气丸由地黄、山药、山茱萸、茯苓、牡丹皮、泽泻、桂枝、附子、牛膝、车前子组成，具有温补肾阳、化气行水的功效，适用于肾虚水肿、腰膝酸软、小便不利、畏寒肢冷。
总而言之，虽然五子衍宗丸和金匮肾气丸都有补肾的作用，但五子衍宗丸主要用于肾精亏虚，金匮肾气丸主要用于肾阳亏虚。建议患者到正规中医院或综合医院的中医科就诊，由中医师辨证后给予合适的治疗药物，不要自行随意用药，以免不良情况发生。