鬼臼毒素酊为外用处方药，具体用多久取决于患者的患处大小，用药后的疗效等因素。一般情况下，每日用药2次，连续3天，停药观察4天为一疗程。如病灶尚有残留可重复一个疗程，但最多不超过三个疗程。具体需要用多久，患者应听从医生的指导，以免治疗不彻底疾病复发或治疗过度造成严重不良反应。
患者涂药前先用消毒、收敛溶液（如高锰酸钾溶液等）清洗患处、擦干；然后用特制药签将药液涂于疣体处，涂遍疣体，不需要重复并尽量避免药液接触正常皮肤和粘膜；每次用药总量勿超过1ml，涂药后暴露患处使药液干燥。
此外，由于本品具有一定的刺激作用，多数患者用药后涂药部位可出现不同程度的烧灼感或刺激感，以及红斑、水肿和糜烂，脱落后局部可出现红斑或浅表糜烂，属于用药后的正常反应，一般情况下无需停药。