八宝丹一般没有明显的副作用，但每个人的体质不同，患者用药期间要注意观察自己的体征变化，如有任何不适症状，请及时咨询医生。
八宝丹具有清利湿热、活血解毒、去黄止痛的功效，用于治疗湿热蕴结导致的发热、黄疸、小便黄赤、恶心呕吐、纳呆、胁痛腹胀、舌苔黄腻或厚腻干白，或湿热下注导致的尿道灼热刺痛、小腹胀痛，以及传染性病毒性肝炎、急性胆囊炎，急性泌尿系感染等见有上述症侯者。以下为本品的禁忌：
1、本品由牛黄、蛇胆、羚羊角、珍珠、三七、麝香等组成，对本品成分过敏的患者禁用本品，过敏体质的患者慎用本品。
2、本品活血作用较强，孕妇不宜服用，以免引起子宫兴奋，导致滑胎。
3、本品仅适用于湿热蕴结的患者，寒湿阴黄者不宜服用，以免因药不对证加重病情。
4、本品性状发生改变，如发霉、变色等时，患者禁止服用。
5、患者服药期间，饮食应该清淡，不宜食用辛辣、生冷、油腻食物，并且戒烟戒酒，这样有助于身体的恢复。
6、本品为处方药，患者应在医生指导下服用，不宜自行服药。服药期间如需合用其他药物，请务必先咨询医生，不可擅自合用，以免发生药物相互作用，影响或加重病情。