医学上没有“小儿咳嗽最怕三种克星”的说法，临床上常用镇咳祛痰药、支气管扩张剂、糖皮质激素、抗感染药物、抗过敏药物、治疗消化系统疾病药物等进行治疗。
1、镇咳祛痰药：小儿一般不常规使用镇咳药，避免影响痰液排出。但对于症状严重的患儿，可酌情小剂量应用右美沙芬等镇咳药，但必须谨慎且严格遵循医嘱用药。对于有痰患儿，可使用盐酸溴己新、乙酰半胱氨酸等祛痰药物，还可根据病情使用蛇胆川贝液、川贝枇杷膏、小儿化痰止咳颗粒等镇咳祛痰类中成药，有时还可雾化吸入祛痰药，能更好的稀释痰液，促进痰液排出。
2、支气管扩张剂：咳嗽严重的患儿可能会出现喘息症状，甚至哮喘发作，可使用β2受体激动剂、白三烯受体拮抗剂、抗胆碱能药物、茶碱类药物等进行治疗。常用药物有沙丁胺醇、孟鲁司特、氨茶碱等。
3、糖皮质激素：使用泼尼松、氢化可的松等糖皮质激素类药物，也可有效缓解小儿咳嗽症状，但应谨慎使用。
4、抗感染药物：小儿咳嗽最常见于呼吸道疾病，而感染是呼吸道疾病的常见原因。咳嗽症状会随着呼吸道疾病的好转而缓解。可根据检查结果，确定相关病原体感染后，进行针对性治疗。病毒感染常用利巴韦林等药物；细菌感染常用阿莫西林、头孢曲松钠、万古霉素、罗红霉素等；结核杆菌感染可用利福平等抗结核药物；寄生虫感染则可使用阿苯达唑等药物。
5、抗过敏药物：过敏性鼻炎等疾病也可导致小儿咳嗽发生，可酌情使用氯雷他定、西替利嗪等药物进行抗过敏治疗。
6、治疗消化系统疾病药物：使用H2受体拮抗剂（如西咪替丁）和促胃动力药（如多潘立酮）等，可治疗胃食管反流等消化系统疾病引发的咳嗽症状。
需要提醒的是，并非所有引发小儿咳嗽的疾病都需药物治疗，还可酌情使用非药物治疗方法，治愈相关疾病，消除咳嗽症状。因此，小儿出现咳嗽症状后，要先查明病因，确诊后再进行相关治疗。