对肾功能最好的抗生素主要是指肾毒性低、代谢效果较好的一类抗生素，主要包括第三代头孢菌素、大环内酯类抗生素、克林霉素类抗生素以及部分青霉素类抗生素等。
1、第三代头孢菌素：在头孢菌素中，第三代头孢菌素的肾毒性最低，其通过抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥抗菌效果，对肾功能的影响较小，代表药物有头孢噻肟、头孢曲松钠等。
2、大环内酯类抗生素：这类抗生素主要经肝胆系统排泄，对肾功能影响轻微，因此，肾功能不全患者可根据情况选用。常用的药物有红霉素、麦迪霉素、螺旋霉素等。
3、克林霉素类抗生素：该类抗生素大多由肝脏代谢，小部分经肾脏排泄，肾毒性较小。常用的药物有克林霉素、林可霉素。
4、部分青霉素类抗生素：青霉素虽然经由肾脏排泄，但其治疗效果稳定、副作用小，因此部分青霉素也可用于肾功能不全者，比如阿莫西林、美洛西林等。
5、其他：包括多西环素、利福平、氯霉素等。
对于肾功能不全的抗感染治疗，医生会尽可能避免使用肾毒性较高的抗生素，并根据患者肾功能减退严重程度和药物本身药代动力学特性，制定个体化的抗菌用药方案，既可确保抗感染治疗效果，又能够减少患者的肾脏负担。