氟尿嘧啶软膏和咪喹莫特都是常见的皮肤科用药，患者应在医生的指导下根据实际情况进行选择，而不能简单评价哪个好。
1、氟尿嘧啶软膏：主要成份为氟尿嘧啶，具有抑制DNA和RNA合成的作用，在临床上常用来治疗尖锐湿疣、寻常疣、跖疣、皮肤淀粉样变、脂溢性角化等问题。对本品过敏、妊娠初期3个月及哺乳期、伴发水痘或带状疱疹以及体质虚弱的患者，应禁用本品。
2、咪喹莫特：即咪喹莫特软膏，能够在用药部位诱导生成α干扰素（IFN-a） 、肿瘤坏死因子（TNF-α）、白介素（IL-1， IL-6， IL-8）等多种细胞因子及相关产物，刺激机体细胞免疫系统识别病毒感染，激发相关免疫应答，最终清除体内致病因子，从而产生免疫调节和间接抗病毒作用。本品在临床上常用于治疗尖锐湿疣、日光性角化病、浅表基底细胞癌和鲍恩病等问题，但不适用于对咪喹莫特乳膏及其基质过敏者，而孕妇和哺乳妇女、老年人及儿童、过敏体质者也应慎用。
需要提醒的是，无论是氟尿嘧啶软膏还是咪喹莫特软膏，都可能与其他药物产生相互作用，因此如果患者正在使用其他药物，则应咨询医生或药师。