肛门和阴道都是穿过骨盆的结构，但解剖位置有所不同。
肛门是肛管的下界，肛管是连接直肠与外界的通道，被肛门括约肌包绕，平时处于收缩状态。整个直肠、肛管肠段位于骨盆内，直肠在第3骶椎前方起自乙状结肠，沿骶、尾骨前面下行，穿过盆膈移行于肛管。肛管位于骨盆的后下方，前方是阴道，后方是尾骨。
阴道是连接子宫和外生殖器的肌性管道，由黏膜、肌层和外膜组成，富伸展性。位于小骨盆中央，前邻膀胱和尿道，后邻直肠。阴道下部较窄而上端宽阔，下端以阴道口开口于阴道前庭，上端环绕子宫颈形成环形凹陷，称为阴道穹。阴道穹以后部最深，与后上方腹膜腔的直肠子宫陷凹紧密相邻仅隔阴道壁和一层腹膜。
在女性的解剖结构中，阴道和肛门前后相邻，但它们是两个完全独立和分开的通道，有各自的功能和解剖结构。在男性中，没有阴道结构，肛门同样位于骨盆的后下方。