基因漂移，即遗传漂变（genetic drift），是群体遗传学概念，指的是小群体或隔离人群中基因频率的随机波动。
在小群体中，由于数量较少，所以有的基因会在传递过程中固定下来传给子代，有的基因则丢失，最终导致该基因在群体中消失。群体越小，基因漂变的速率越快，常常在几代后甚至一代后即可出现基因的固定和消失。与之相反的是在大群体中，个体可以充分地随机交配，所以不同基因型的频率可维持在平衡状态，不会出现某种基因的固定或丢失。
遗传漂变现象主要说明的是种群个体数量对于维持种群性状多样性的重要程度，遗传漂变对小群体的影响尤其显著。例如丹吉尔病是一种罕见的常染色体隐性遗传病，本病在全世界只有50多个患者，大多集中于美国的Tangier岛上。该岛居民仅有700多人，由于地理位置相对隔离，岛上居民很少与外界通婚，致病基因由于遗传漂变作用，在岛上居民中频率很高。
正因为遗传漂变现象存在，临床上禁止近亲通婚，因为在较为封闭的家族内部通婚，家族成员内遗传病传递给子代的几率会明显上升。此外，了解遗传漂变，也有助于研究某些疾病的发生与传播，发现其高危人群并进行早期筛查、诊断。