金荞麦一般没有明显的副作用，但由于患者对药物的敏感性不同，部分患者应用后可能会出现恶心、胃部不适等胃肠道症状。如果患者用药后出现了明显不适，建议及时就医咨询。金荞麦的禁忌方面，主要包括对该药过敏者禁止应用、不宜同时服用温补性中成药、用药后避免日晒等。
1、对该药过敏者禁止应用：如果患者对金荞麦过敏，则不能应用该药，否则可能会出现皮肤红斑、丘疹、瘙痒甚至呼吸困难等过敏反应。
2、不宜同时服用温补性中成药：在应用金荞麦期间不宜同时服用温补性中成药，比如八珍丸、十全大补丸、人参归脾丸等。因为金荞麦性凉，具有清热的作用，服用温补性中成药可能会使药效降低。
3、用药后避免日晒：服用金荞麦后应避免日晒，否则可能会诱发光敏反应，比如皮疹、皮肤红肿及瘙痒等。
需要明确的是，有用药需求者，应由专业中医师辨证后使用，不要自行随意使用，更不能随意听信中药偏方。在用药期间，患者不宜自行合用其他药，以免药物间相互作用影响治疗，如果有需要，应咨询医生或药师。