金樱子的籽不具有药用价值或食用价值，属于非药用部位或非食用部位，不管是作药用还是作保健品食用，都需要挖去籽。所以不存在“金樱子去籽和不去籽的区别”一说。金樱子作药用时，具有固精缩尿、固崩止带、涩肠止泻的功效。
1、固精缩尿、固崩止带：金樱子味酸而涩，入肾与膀胱经，功专固敛，能敛肾气、固精关、止遗滑、缩小便、疗崩带。可用于治疗肾气不足、下元不固导致的神疲乏力、腰膝酸软、遗精滑精、尿频遗尿、崩漏带下等。
2、涩肠止泻： 金樱子味酸收敛，涩可去脱，入大肠而涩肠止久泻，可用于治疗脾虚失运、气虚下陷导致的久泻久痢、脱肛阴挺。
此外，金樱子还可应用于保健食品领域。不过需要注意，保健食品是食品而不是药品，不能替代药物。选购保健食品要认清认准产品包装上的保健食品标志及保健食品批准文号，依据其功能及适宜人群有针对性的选择，并按标签说明书的要求食用，切忌盲目购买和使用。