六神丸治疗毛囊炎的效果是比较好的。六神丸可以缓解毛囊炎导致的红肿、瘙痒、疼痛等症状，但具体的治疗效果因人而异。
六神丸具有清热解毒、消肿利咽、化腐止痛的功效，可用于热毒导致的咽喉肿痛、吞咽困难、疖肿（急性化脓性皮肤病）、皮肤的红肿热痛等。现代药理研究表明，本品还具有明显的抗病毒、抗炎镇痛、强心、抗肿瘤等作用，临床上还用于治疗急慢性咽喉炎、急慢性扁桃体炎、咽喉肿痛化脓、白喉、淋巴管炎、牙周炎、毛囊炎，以及流行性感冒、流行性腮腺炎、带状疱疹、病毒性肝炎、白血病等。
毛囊炎是常见的毛囊炎症性皮肤病，可发生于身体任何毛囊部位，头面部、颈部、大腿、臀部及腋窝等部位多见。常见临床表现为毛囊周围的红色丘疹，有时可出现化脓、瘙痒、疼痛等症状。毛囊炎患者平时保持皮肤干燥、清洁，避免搔抓皮肤或挤压脓疱，以免引起感染。还要养成良好卫生习惯，使用温度适宜的清水洗浴，避免使用刺激性沐浴产品。
六神丸含有的蟾酥、雄黄有一定的毒性，使用不正确或者过量使用，很容易导致中毒反应，所以患者不可以自行购买使用，应在医师指导下，按照医嘱用药。