毛囊长在头皮下，肉眼不能发现它是否出现萎缩。很多患者因脱发问题就医，进行毛囊检查发现了毛囊萎缩的情况。毛囊萎缩的原因较为复杂，可能与一些内分泌异常有关，比如雄激素性过多，亦可能是营养不良或微量元素的缺乏导致的，日常生活中拔毛或者随意烫染头发均可能损伤毛囊。所以毛囊萎缩的激活或治疗应首先明确病因。
1、积极治疗原发病
激素缺乏者，应在医生的指导下补充激素。营养不良导致者应在医生指导下适当补充营养制剂和调整饮食。
2、改良生活习惯
需注意作息规律，避免精神紧张或者劳累过度，平时尽量减少烫染，避免长期佩戴较紧头饰。
3、刺激毛囊生长
可使用部分刺激毛囊的药物，如米诺地尔等。适当的头部按摩也有助于毛囊激活。部分中药及针灸等对于激活毛囊可能也有一定帮助。
4、毛发植发
患者如果头皮毛囊萎缩严重，可能无法激活时，可选择毛发移植。是通过特殊器械将正常毛发供区的头发连同皮肤脂肪组织一并完整切取，使其脱离头皮原位，然后移植到头皮脱发区或身体其他毛发脱失部位，使移植后的毛发保持原来的所有生长特性，并在新的移植区域内继续生长。被移植的组织一旦存活，效果通常可以长期维持。