核磁共振即磁共振成像（MRI），是颅内各种疾病的主要影像检查技术，并可作为一些疾病，如超急性脑梗死、脑转移瘤等的首选检查方法，也是CT检查的重要补充。具有组织分辨力高、多序列、多参数、多方位和多种功能磁共振成像（fMRI）检查等优势，能够更敏感地发现病变并显示病变特征，从而有利于疾病的早期检出和准确诊断。MRI检查颅内疾病也有一定限度，例如对病变内钙化的确定较为困难，较少用于急性脑出血、急性蛛网膜下腔出血和一般急性颅脑外伤等急症检查。
磁共振成像检查可分为普通磁共振检查、增强磁共振检查、磁共振血管成像（MRA）检查、高分辨核磁共振波谱图（H-MRS）检查、扩散加权成像（DWI）、扩散张量成像（DTI）、灌注加权成像（PWI）。可用于检查不同类型疾病，如下：
1、普通磁共振检查
（1）可根据信号的变化显示出肿块、囊肿、水肿、出血以及梗死区域，可用于检查脑内的上述病变。
（2）可以发现脑内结构改变，检查颅内占位性病变（如肿瘤等）、脑萎缩、脑积水等疾病。
2、增强磁共振检查
在进行增强磁共振检查时，需经静脉注射对比剂（俗称造影剂），这样有利于提高MRI检查的敏感性和特异性，在对比剂的作用下病变可有不同程度的强化，不同的强化提示不同的疾病：
（1）均匀性强化：见于脑膜瘤、转移瘤、神经鞘瘤、动脉瘤和肉芽肿等。
（2）非均匀性强化：见于胶质瘤、血管畸形等。
（3）环形强化：见于脑脓肿、结核瘤、胶质瘤、转移瘤等。
（4）无强化：见于脑炎、囊肿、水肿等。
3、磁共振血管成像（MRA）检查
可用于检查脑动脉粥样硬化、颅内动脉瘤、颅内动静脉畸形以及颅内占位性病变。
4、高分辨核磁共振波谱图（H-MRS）检查
可以检查脑肿瘤、脑梗死、脑脓肿等疾病。
5、扩散加权成像（DWI）和扩散张量成像（DTI）
（1）扩散加权成像（DWI）：可用于超急性期脑梗死、脑肿瘤和脑脓肿等疾病。
（2）扩散张量成像（DTI）：可以检查脑梗死、脱髓鞘疾病、高级别星形细胞肿瘤等。
6、灌注加权成像（PWI）
可以检查脑缺血性疾病以及脑肿瘤。