蛇床草的果实入药，称为蛇床子。蛇床子味辛、苦，性温，归脾、肾经，具有温肾壮阳、燥湿杀虫、祛风止痒的功效，主治阴部湿痒、湿疹、疥癣、寒湿带下、湿痹腰痛、肾虚阳痿、宫冷不孕等。现代研究表明，蛇床子具有抗心律失常、降压、平喘、祛痰、扩张支气管、抗病原微生物、增强免疫功能、抗变态反应、镇痛、局麻、改善脑功能、促进记忆、抗骨质疏松、抗炎、抗诱变、性激素样等作用。
蛇床子可内服可外用。内服时多与其他中药配伍应用于中药组方中煎煮，或入丸、散剂。外用可煎汤熏洗；或做成坐药、栓剂；或研细末调敷。由于每位患者病情、体质等因素不同，具体用量会存在个体化差异，请患者严格按照医生处方规定的剂量使用本品。
蛇床子是临床上常用的一种中药，若需要服用本品治病或调理身体，建议在医生的指导下服用，以免发生用药风险。下焦湿热或相火易动，精关不固者禁服本品。