香蒲与菖蒲在来源、性状、功效主治等方面均有区别：
1、来源：香蒲为香蒲科香蒲属的多年生水生或沼生草本植物。菖蒲为天南星科菖蒲属多年生草本植物。
2、性状：香蒲根状茎乳白色，地上茎粗壮，向上渐细，叶片条形，光滑无毛，上部扁平，下部腹面微凹，背面逐渐隆起呈凸形，横切面呈半圆形，细胞间隙大，海绵状；叶鞘抱茎。菖蒲根茎横走，稍扁，分枝，外皮黄褐色，芳香，肉质根多数，具毛发状须根，叶基生，叶片剑状线形，花序梗二棱形，柄三棱形，叶状佛焰苞剑状线形，肉穗花序斜向上或近直立，狭锥状圆柱形。
3、功效主治：香蒲主要以花粉入药，称为蒲黄，蒲黄具有止血、化瘀、通淋的功效，用于吐血、衄血、咯血、崩漏、外伤出血、经闭通经、胸腹刺痛、跌扑肿痛、血淋涩痛。菖蒲主要以根茎入药，以石菖蒲为例，石菖蒲具有开窍豁痰、醒神益智、化湿开胃的功效，用于治疗神昏癫痫、健忘失眠、耳鸣耳聋、脘痞不饥、噤口下痢。
