少精子症最常见的病因是性腺功能不全或性腺功能低下。此外，输精管道的不完全阻塞也会导致少精子症。

1、性腺功能不全或性腺功能低下，实际上就是睾丸的功能下降。睾丸有产生精子和激素的功能，如果睾丸产生精子的功能下降，就会导致精子数量减少，出现少精子症。

2、输精管道的不完全阻塞，包括附睾、输精管、前列腺、精囊腺等精子的通路出现不完全阻塞也会导致少精子症。