安宫牛黄丸为处方药，需要在医师指导下辨证使用，不要自己盲目用药。就医时，应告知医师您的疾病史、近期用药情况、家族史、过敏史等，以排除用药禁忌。
本品是治疗热闭神昏（表现为高热烦躁、神志不清、言语混乱等）的药物，寒闭神昏者（表现为面色青紫、身体发凉、神志不清等）则应避免使用，不然会导致病情加重。这两种病情表现虽然相像，但用药有所差异，大家一定要在医生辩证后服用正确的药物，不要随意选择。
安宫牛黄丸中含有麝香，对于孕妇来说，只有当药物对母体潜在的益处大于对胎儿的潜在风险时，才可以在医生指导下服本品。此外，本品还含有朱砂、雄黄，肝肾功能不全者应当慎用，其他患者也要避免长期或大剂量使用，以免发生中毒反应。
安宫牛黄丸为热病的急救用药，不能作为日常保健品或者预防治疗用药。服药时，不要整粒吞服，最好嚼服或者用温开水化开后服用。治疗过程中，如果出现四肢冰冷、怕冷、面色苍白、冷汗不止、脉微欲绝等症状，应立即停药并就医。用药期间，需要清淡饮食，忌辛辣油腻的食物，不然不利于身体的恢复。