大蒜素软胶囊一般不会引起头痛，大蒜素软胶囊是一种抗菌药。临床上，本品主要用于治疗深部真菌和细菌感染，如肺部及消化道霉菌感染、白色念珠球菌菌血症、急慢性菌痢、急慢性肠炎、百日咳等。
大蒜素软胶囊的主要成分为大蒜素，大蒜素是从大蒜中提取而得的一种具有杀菌作用的成分，其对多种球菌、百日咳杆菌、白喉杆菌、痢疾杆菌、伤寒及副伤寒杆菌、大肠埃希菌、结核杆菌等有抑制和杀菌作用；对真菌有抑制作用；对阿米巴原虫、阴道滴虫、蛲虫等也有抑制杀灭作用。
大蒜素软胶囊属于处方药，须在医师指导下使用，患者不宜自行服用，若您服用大蒜素软胶囊后出现头痛的症状，请及时就医与医生进行讨论。以明确头痛出现的病因，并进行相应的治疗。