肩胛骨缝疼痛可能是由于外伤、劳损、压迫等原因，从而造成局部软组织发生损伤、骨骼病变所致，也可能是由于其他部位病变放射至此处所致。
1、软组织损伤：由于肩部受凉、长时间姿势不当、急性外伤、剧烈活动、退行性病变等原因，都可引起肩胛骨周围组织发生急慢性炎症，如筋膜炎、肌腱炎、骨关节炎等，从而导致肩胛骨缝部位出现疼痛，同时可伴有肿胀、结节、活动受限等表现。
2、骨骼病变：例如外伤引起的肩胛骨骨折、肩关节脱位，或由于局部肿瘤或转移瘤的侵袭、压迫等，都可能会导致肩胛骨缝出现疼痛，并可伴有局部畸形或肿物等。
3、其他器官病变：如心绞痛、心肌梗死、胸膜炎、胆囊炎、胆囊结石等多种疾病，都可出现放射性疼痛，进而导致肩胛骨区域出现疼痛。这类患者通常还伴有特征性的症状表现，例如心脏疾病者可能心慌、气短、心前区憋闷疼痛症状，胸膜疾病者可能伴有咳嗽、咳痰、胸痛、呼吸困难等症状，胆囊疾病者可能伴有食欲减退、恶心呕吐、黄疸等症状。
4、其他：年龄、工作、生活习惯等因素是本病发生的重要因素。
综上所述，建议肩胛骨缝持续疼痛或反复发作或疼痛严重者，及时到正规医院的骨科、急诊科就诊，完善体格检查、X线或CT检查，若怀疑存在其他系统疾病者，则需要完善心电图、心肌酶谱及肌钙蛋白、超声心动图，或血常规、痰培养、胸部CT，或肝胆脾彩超、增强CT、肝功能等检查。由专科医生明确诊断，并根据具体病因确定治疗方案。