在医学上，指甲上有小坑通常是指指甲凹陷，可能是由多种原因引起的，主要包括营养不良、指甲损伤、手部湿疹、银屑病、甲癣等。
1、营养不良：营养素缺乏，特别是铁元素缺乏，会影响指甲的生长，从而引起指甲凹陷的症状。
2、指甲损伤：由于撞击、挫伤等原因，可以直接损伤甲板，从而使指甲凹陷。同时，接触某些具有腐蚀性、刺激性的化学制剂，也可能会对甲板造成损伤，进而导致本症发生。
3、手部湿疹：湿疹是一种病因复杂的皮肤疾病，往往会引起皮肤瘙痒、水疱、脱屑等不适症状。对于存在手部湿疹的患者，如果累及指甲，就可能导致指甲发育异常，进而出现指甲凹陷的表现。
4、银屑病：是一种多种因素相互作用所致的慢性鳞屑性皮肤病，典型表现为皮肤表面出现红斑，其表面覆有银白色鳞屑，并伴有剧烈瘙痒症状。如果累及指甲，则可能会呈“顶针状”或点状凹陷、甲分离、甲下角化过度等改变。
5、甲癣：由于皮肤癣菌侵犯甲板，可以导致指甲出现凹凸不平的改变，同时通常伴有指甲颜色、形状、质地的改变。
6、其他：甲沟炎、甲状腺疾病、雷诺综合征、缺氧、心脏疾病等多种原因，也可能会影响指甲正常生长，进而引起指甲出现凹陷的改变，但通常会伴有原发疾病的临床表现。
综上所述，建议指甲出现凹陷的患者及时到正规医院的皮肤科就诊，由专科医生明确诊断，并根据病因开展专科治疗。患者不宜自我判断或自行用药，以免造成病情延误或加重指甲损伤，进而给身心造成不利影响。