在医学领域中，CT值主要用在两个领域，即计算机断层扫描（CT）和实时定量聚合酶链式反应（RT-qPCR）。
1、计算机断层扫描中的CT值：在CT中，CT值代表CT图像中各组织与X线衰减系数相对应的数值，以Hounsfield（HU）为单位，一般水的CT值被定义为0HU，而空气的CT值被定义为-1000HU。相对于这两个基准，其他物质如骨、脑组织等在CT图像上的亮度可以进行相对的量化。例如，骨组织的CT值通常大于400HU，而肝脏的CT值则在50~70HU之间。这些参考值可以帮助医生判断扫描部位的密度是否正常。
2、实时定量聚合酶链式反应中的CT值：在实时定量聚合酶链式反应中，CT值的全称为循环阈值（Cycle Threshold），即起始荧光值达到阈值所需的循环次数。RT-qPCR主要用来检测特定序列DNA的数量，通过不断的DNA复制过程，使得DNA的数量呈指数增长，同时这个过程中会产生荧光信号。当荧光信号达到一定的阈值，说明有足够的DNA被复制出来。而此时所经过的循环次数即为CT值。CT值越低，说明样本中目标DNA的初始浓度越高。
总的来说，CT值在医学中的意义因其应用领域分别为表示X-射线衰减强度或者DNA起始荧光阈值所需循环次数，其准确理解需要结合所在语境。
