服用龟龄集可能会伤到腹中的胎儿，所以孕妇应避免使用。感冒者也应暂停使用本品治疗，以免感冒症状加重。
由于龟龄集中含有甘草、丁香、红参，所以不可以与含有甘遂、大戟、海藻、芫花、郁金、藜芦的制剂合用，如祛痰止咳颗粒、紫金锭、心通口服液、温经颗粒、三七血伤宁胶囊等，以免发生严重的毒副反应。服药期间，也不要吃辛辣、生冷的食物，如西瓜、梨、橙子、火龙果、苦瓜、海鲜、辣椒、生姜、胡椒、花椒、大蒜等。
龟龄集为处方药，需要在医师指导下使用，它可以用于治疗肾阳虚引起的记忆力减退、阳痿、早泄、遗精、腰腿酸软、（气虚）咳嗽、食欲不振、黎明前腹泻或大便稀薄等。就医时，应向医生说明自己的不适症状、疾病史、过敏史、近期用药情况等，以方便医师排除用药禁忌，制定合理的治疗方案。用药期间，最好不要自己合用其他药，如果需要合用，应提前咨询医师或者药师。