排尿时尿道刺痛的原因，主要包括不良卫生习惯、机械性刺激、应用某些药物、泌尿系统感染、尿路梗阻、性传播疾病等。
1、不良卫生习惯：如不经常清洗外阴或使用不当的清洁方式等，可能导致细菌等病原体在尿道口和周围环境中繁殖，并可进入尿道造成炎症反应，从而引发尿道刺痛、灼热感等症状。
2、机械性刺激：如长时间骑行、紧身衣物、性行为等可对尿道造成物理性刺激或摩擦，导致尿道黏膜刺激或轻微损伤，从而引起排尿时刺痛。
3、应用某些药物：如环磷酰胺等，可刺激膀胱引起出血性膀胱炎，从而导致排尿时刺痛。
4、泌尿系统感染：如急性肾盂肾炎、急性细菌性膀胱炎、淋球菌性尿道炎等，则可能导致尿道组织发生炎症反应，造成导致尿道壁红肿，从而引起排尿时刺痛。
5、尿路梗阻：如尿道结石、膀胱结石、膀胱癌等，可导致尿液流动受阻，增加尿道内压力，从而导致排尿时刺痛。
6、性传播疾病：如淋病、生殖器疱疹等，可导致尿道黏膜发生炎症反应，从而引起排尿时刺痛。
7、其他：如肾结核、Reiter综合征、Behcet综合征、膀胱瘘等，也可能导致排尿时刺痛。
综上所述，临床上引起排尿时尿道刺痛的原因较多，建议患者首先注意适当增加饮水量、清淡饮食、保持会阴部清洁等，若症状依旧存在，或有所加重，或伴有尿频、尿液浑浊等症状，则应及时前往正规医院的泌尿外科，通过尿常规、超声等检查，确定病因，然后采取针对性治疗，以尽快改善不适症状。