合胞病毒感染用什么药最好，不能一概而论，因为目前没有针对合胞病毒的特效药，临床上主要根据患者的症状采取对症药物治疗，仅对重症患者使用广谱抗病毒药物利巴韦林治疗。
1、对症药物：合胞病毒感染，多数引起的都是轻到中度的上呼吸道症状，类似于普通感冒，有一定自限性，所以主要采取对症治疗缓解症状，减轻患者不适即可。比如发热患者可使用布洛芬等退烧药，鼻塞患者可使用伪麻黄碱等减充血剂。不同患者的临床症状有所差异，需针对具体情况使用相应药物。
2、抗病毒药物：目前没有特效的针对合胞病毒的抗病毒药物，抗病毒药物选择非常有限。利巴韦林是唯一被某些国家批准用于治疗重症合胞病毒感染的广谱抗病毒药。利巴韦林存在一定的副作用，用药受到严格限制，需由专业医生完整评估病情后使用。
总之，由于合胞病毒感染通常是自限性的，且目前缺乏广泛认可的抗病毒药物，所以不存在所谓的治疗合胞病毒感染的最好用药。轻症患者应阅读药物说明书，根据自身情况选择一些非处方对症药物，症状较重、病情持续的患者需及时就医，在医生指导下用药。