治疗支原体肺炎主要依赖抗生素，而在抗生素的选择上，大环内酯类抗生素如阿奇霉素是最常用的。
阿奇霉素的作用机制是阻断肺炎支原体的蛋白质合成，这样可以阻止肺炎支原体的生长和繁殖。此外，氟喹诺酮类抗生素，如左氧氟沙星和莫西沙星，也可以用于治疗，特别是在患者对大环内酯类药物有耐药性或过敏反应的情况下。
除抗生素外，对症治疗也很重要。例如，通过对乙酰氨基酚和布洛芬等解热镇痛药物来缓解发热和疼痛，通过右美沙芬、氨溴索、羧甲司坦等止咳祛痰药物来缓解咳嗽和帮助排痰。
重要的是，患者应按照医生的医嘱服用药物，确保足疗程用药，即使症状提前消失也不能自行停药，以免病情复发。同时，患者应保持良好的卫生习惯，适当调整居住环境，如保持室内通风，避免到人员聚集的场所，以减少病原体滋生和传播的风险。