指甲不平有凹凸可能是由多种因素所引发的，主要包括营养不良、甲外伤、甲癣、甲沟炎以及甲扁平苔藓等。
1、营养不良：指甲的正常生长需要充足的蛋白质、维生素和矿物质等营养物质的支持。如果日常饮食中偏食或挑食，导致这些重要营养素摄入不足，就可能引发指甲异常，表现为凹凸不平。
2、甲外伤：当指甲受到挤压、撞击等外力作用时，甲床可能会受损，进而影响指甲的平滑生长，从而引起指甲表面不平有凹凸。
3、甲癣：如果患有甲癣，则皮肤癣菌可侵犯甲板，从而引起指甲不平有凹凸。
4、甲沟炎：甲沟炎是指甲周围组织的炎症，主要因病原菌感染所致。该病患者的甲周组织可出现红、肿、热、痛，通常还可出现甲形态的变化，表现为凹凸不平、甲板变圆等。
5、甲扁平苔藓：当扁平苔藓侵及甲板时，在局部炎症的影响下，可引起指甲不平有凹凸。
鉴于指甲不平有凹凸的原因比较多，患者很难自行判断，建议尽早到正规医院的皮肤科就诊，由医生明确诊断，并进行针对地治疗，以促使指甲恢复正常。