右归丸和左归丸首先在成分上有所不同，右归丸由熟地黄、附子（炮附片）、肉桂、山药、山茱萸（酒炙）、菟丝子、鹿角胶、枸杞子、当归、杜仲（盐炒）组成。左归丸由熟地黄、菟丝子、牛膝、龟板胶、鹿角胶、山药、山茱萸、枸杞子组成。
其次，两药的功效和作用不同。两药虽然都可以用于补肾，但肾虚分为肾阳虚和肾阴虚。右归丸用于治疗肾阳虚、命门火衰导致的腰膝酸软、怕冷、四肢发凉、精神不振、阳痿遗精、大便稀薄不成形等。左归丸用于治疗肾阴虚导致的腰膝酸软、盗汗（入睡后汗出、醒后汗止）、耳鸣、口干舌燥、遗精早泄等。二者适用的症状既有相同之处，也有不同之处，使用时需要辨证清楚后再用药，最好是在医生的指导下判断您适合服用哪种药物进行治疗。
