注射用头孢曲松钠适用于对本品敏感的致病菌引起的呼吸道感染（尤其是肺炎）、耳鼻喉感染（如急性中耳炎）、泌尿系统感染、败血症、脑膜炎（如播散性莱姆病早、晚期）、骨和关节感染、皮肤软组织感染、腹腔感染（腹膜炎、胆道及胃肠道感染）、生殖系统感染包括淋病，也可用于术前预防感染。以下为本品的一些禁忌人群：
1、对头孢菌素过敏的患者患者禁用本品。对青霉素过敏的患者使用本品可能存在交叉过敏现象，应慎用本品。过敏体质者慎用本品。
2、妊娠及哺乳期妇女应在确实必要时才可在医生指导下使用本品。
3、头孢曲松可将胆红素从血清白蛋白上置换下来。患有高胆红素血症的新生儿（尤其是早产儿）可能发展成核黄疽，应禁用本品。
4、严重肝肾功能不全的患者，建议严密监测临床用药安全性和有效性，以免出现用药风险。
总之，本品应在专业的医师指导下给药，且医院能对过敏反应采取急救措施。用药过程中出现任何严重、持续或进展性的症状，应及时报告医生，以免出现用药危险。