儿童应在儿科医生指导下使用注射用头孢曲松钠，在用药前应进行皮试，且所就诊的医疗机构能对过敏反应采取急救措施。使用本品前，需详细询问患者病史，包括青霉素类、头孢菌素类、其他任何药物过敏史、过敏体质、家族史等，以免出现严重不良反应。
儿童由于体质较为特殊，其用药方案与成人不同，通常按照儿童体重来计算用药量，儿童家长不可自行给孩子使用本品，本品不宜用于新生儿。
对头孢菌素过敏的患者患者禁用本品。对青霉素过敏的患者使用本品可能存在交叉过敏现象，应慎用本品。过敏体质者慎用本品。本品不宜长期使用，长期使用本品会使不敏感菌过度生长，可致二重感染如念珠菌病、阴道炎。患者不可自行延长用药时间。