维生素B类药物通常对月经无影响，经期吃维生素B一般没什么问题，但由于个体差异，用药前最好还是先咨询医生或药师。内分泌紊乱、器官病变、全身疾病、精神因素等可能会导致月经紊乱，一些日常不健康的生活习惯也可能引起月经不调。而维生素B类，是人体必需的营养物质，通常不会导致上述情况。但也有些特殊体质患者的生理情况本就不稳定，可能受药物影响较大，月经会因药物而失调，需注意。
就B族维生素引起的不良反应来说，B1、B2很少有毒副作用，但在过量时，容易引起颤抖、紧张、心跳加速、麻木、刺痛感等反应；维生素B12有引起低血钾、高尿酸血症的风险；维生素B6在长期、过量服时，可导致严重的周围神经炎，表现出感觉异常、步态不稳、手足麻木等。
现在还有许多复合维生素制剂，如复合维生素B片，是维生素B1、B2、B6的复合制剂，也有不良反应如皮肤潮红、瘙痒等，大剂量服时还会引起烦躁、疲倦、食欲减退、尿液发黄等症状。