水蛭蛋白肽一般是指水蛭肽，是一种重组水蛭素，具有抗凝、抗血栓作用。
水蛭素是一种来源于水蛭唾液的抗凝成分。研究表明，水蛭素可以抑制凝血酶活性，减少纤维蛋白生成，从而达到抗凝作用，也可抑制凝血酶所引起的血小板聚集和分泌，进而产生抗血栓作用。但由于天然水蛭素来源较少，因此人们以水蛭素为模板，利用基因重组技术设计出了肽类凝血酶抑制剂，即水蛭肽。
在目前研究中，水蛭肽都显示了较强的抗凝、抗血栓的作用效果，其中一种上市药物比伐芦定就是一种水蛭肽，主要用于急性冠脉综合征（ACS）患者进行经皮冠状动脉介入治疗（PCI）中的抗凝。此外，由于不同设计者设计的水蛭肽在结构和功效方面存在差异，因此关于水蛭肽的动物实验和临床试验仍在进行。
值得注意的是，中药水蛭目前主要以中药饮片形式销售；水蛭肽类药物，除比伐芦定外，多数仍处于研发、试验阶段。因此，建议患者务必在医生指导下使用水蛭、水蛭肽或水蛭素等药物，避免自我诊断或自行用药，以免因使用不当而造成病情延误或增加用药风险，进而给身体造成不必要的伤害。
