盐酸米诺环素软膏一般不会引起患者头痛，本品为牙科局部注射用药，不良反应较少，少数患者用药后会出现局部刺激，属于一过性的不良反应，减慢药物注射的速度可明显缓解此症状。由于个体差异，不同患者用药后的表现可能不同，若您用药后出现头痛，应及时告知医生，医生可根据您的具体情况为您明确导致头痛的原因，并进行适当治疗。必要时，调整用药方案。
盐酸米诺环素软膏在临床上主要用于改善对本品具有药敏性的牙龈卟啉菌、中间型普氏菌、产黑色素普氏菌、腐蚀埃肯菌、核梭杆菌、伴放线放线杆菌导致的牙周炎（慢性边缘性牙周炎）的各种症状。
盐酸米诺环素是一种广谱抗生素，对多种病菌均有较强的抗菌活性，例如金黄色葡萄球菌、链球菌、淋病奈瑟氏菌等。除此之外，肺炎双球菌、大肠杆菌、铜绿假单胞菌、沙眼衣原体、脓尿支原体等，对盐酸米诺环素也有一定的敏感性。