盐酸米诺环素软膏不是减肥药，不能用于减肥。希望减肥的患者应从饮食习惯、运动方面进行调整，若减肥效果不佳，可在医生或药师指导下选择合适的减肥药，而不可随意使用不对症的药物，以免产生严重用药风险。
盐酸米诺环素软膏在临床上主要用于改善对本品具有药敏性的牙龈卟啉菌、中间型普氏菌、产黑色素普氏菌、腐蚀埃肯菌、核梭杆菌、伴放线放线杆菌导致的牙周炎（慢性边缘性牙周炎）的各种症状。
盐酸米诺环素是一种广谱抗生素，对多种病菌均有较强的抗菌活性，例如金黄色葡萄球菌、链球菌、淋病奈瑟氏菌等。除此之外，肺炎双球菌、大肠杆菌、铜绿假单胞菌、沙眼衣原体、脓尿支原体等，对盐酸米诺环素也有一定的敏感性。