复方玄驹胶囊属于处方药，用药前需要先到医院看一下医生，由医生明确诊断疾病和病因后再使用。有药物过敏史、过敏体质者要慎重用药。另外，阴虚火旺者一般不适宜服用本品，这类患者主要表现为五心烦热（自觉手足心热、心胸躁热）、潮热（每日某个特定时间自觉热感从面或胸蔓延至全身）、盗汗（夜间入睡后汗出，醒后汗止）等。
复方玄驹胶囊是治疗肾阳虚的中成药，男女都可以用，适用于神疲乏力、精神不振、腰膝酸软、男性精子质量过差、功能性勃起功能障碍、女性痛经、经血发黑、手脚冰凉、性欲低下等，也用于改善类风湿关节炎属于肾阳不足、风寒痹阻证引起的关节疼痛、肿胀。
用药期间最好按照医生的要求定期复诊，医生会根据复诊结果判断是否需要调整用药。服药时还要注意合理休息，饮食上要少吃生冷、辛辣、油腻的食物。如果用药后出现恶心、呕吐、头晕等不适症状，可以饭后服用，或咨询医生后减量服用。用药期间如果需要服用其他药物，请先咨询一下医生，以免自我用药而发生药物相互作用，从而影响药物疗效或增加药物的毒副作用等。