百日咳一般不能自行痊愈，这主要与其病原体特性、病程较长、并发症风险等有关。
1、病原体特性：百日咳是由百日咳杆菌感染引发的，这种细菌在呼吸道内繁殖并产生毒素，导致纤毛受损、气管炎症反应加剧，从而引起典型的阵发性咳嗽。这些病理变化需要通过特定的治疗手段来缓解，一般无法通过机体的自我修复能力实现自愈。
2、病程较长：百日咳的病程通常较长，可能持续数周甚至数月。在病程的不同阶段，患者会出现不同的症状，如卡他期的低热、咳嗽等类似感冒症状，痉咳期的剧烈咳嗽和鸡鸣样吸气吼声，以及恢复期的咳嗽减轻等。由于病程较长且症状严重，自行痊愈的可能性较小。
3、并发症风险：如果不及时治疗，百日咳可能会引发一系列严重的并发症，如支气管肺炎、肺不张、呼吸暂停、发绀、惊厥等，甚至危及生命。这些并发症的发生进一步降低了自行痊愈的可能性。
综上所述，百日咳患者需要在医生指导下进行规范治疗，以减轻症状、缩短病程、降低并发症发生的风险并防止疾病传播。