藿香正气水没有直接退烧的作用，发烧的患者不要随意使用。一般对于发烧的患者，如果体温低于38.5℃，建议进行物理降温，可以用毛巾包裹冰袋冰敷头部、腹股沟或腋窝，用温水擦浴或酒精擦身。如果体温高于38.5℃，可以选择对乙酰氨基酚、阿司匹林、布洛芬等进行对症治疗，但12岁以下儿童要禁用阿司匹林，中成药可以选择银翘散、感冒灵颗粒等。
发烧的患者要注意多休息、适当补充水分，均衡膳食，多吃富含维生素等营养物质的食物，避免辣刺激性食物，适度运动等，有助于增强体质，促进疾病康复。
藿香正气水是夏季常用的解暑药物，具有解表化湿，理气和中的功效，用于外感风寒、内伤湿滞或夏伤暑湿所致的感冒，以及胃肠型感冒，表现为怕冷、头痛、头昏、胸闷、呕吐、腹泻、腹胀以及周身沉重等。用药前一定要先明确自己是否适合服用本品，只有对症用药才能发挥药物的疗效，否则可能增加用药风险。