在药物方面，石斛不能和雷丸、僵蚕、大黄等中药一起服用，也不建议与阿托品联用；饮食上应避免与辛辣食物、温热性滋补食材及寒凉食物同时食用。
一、药物搭配
1、雷丸、僵蚕：《本草纲目》记载：“（石斛）畏雷丸、僵蚕。“畏”即指一种药物能抑制另一种药物的功效，使其作用减弱或消失。石斛若与雷丸、僵蚕同用，其益胃生津、滋阴清热的功效会被抑制，故应避免联用。
2、大黄：石斛以滋补阴液为主，而大黄药性峻猛，擅长攻下泻热、通便。二者一补一泻，作用方向相反。若同用，大黄的泻下作用可能抵消石斛的滋阴功效。
3、阿托品：石斛有增强肠管平滑肌的紧张度和收缩活动的作用，可以轻度抑制阿托品对于心肌和肠管平滑肌的作用，故不宜同用。
二、饮食禁忌
1、辛辣食物：如辣椒、芥末、生姜、大蒜等。这类食物性温燥，易助热生火、耗伤阴液，与石斛滋阴清热的功效相悖。同食可能加重体内燥热，削弱石斛对阴虚症状的调理效果。
2、温热性滋补食材：如羊肉、桂圆等。这类食物性质温热，可能加剧体内阴液消耗。若与石斛同食，可能抵消其滋阴作用。
3、寒凉食物：如螃蟹、生鱼片、冷饮等。石斛本身性微寒，叠加其他寒凉食物可能加重寒凉之性，损伤脾胃阳气，导致腹胀、腹泻、食欲不振等。尤其是脾胃本身不好的人群，更需注意。
需要提醒的是，服用石斛期间若需联用其他药物（包括中药、西药），务必咨询中医师或药师，明确是否存在配伍禁忌。饮食方面，以清淡、平和饮食为主。