云南白药痔疮膏含有制草乌，虽然局部外用药通常不会与口服药发生相互作用，但以防万一，建议最好还是不要与半夏、瓜蒌、贝母、白蔹、白及、犀角或其制剂合用，如柏子养心丸、蜜炼川贝枇杷膏、连翘败毒丸、牛黄清心丸、利肺片等。本品与其他药物合用也有可能出现药物相互作用，如果需要同时使用其他药物，请先咨询医生。
云南白药痔疮膏为处方药，需要凭医生处方购买，具体的用法用量也要听医生的，医生会根据您的身体状况，病情情况等，制定适合您的用药计划，请患者不要自行调整剂量或者参考其他患者的剂量用药。个别患者在初次使用本品时，会出现局部烧灼感，数分钟后这种不适感会减缓并消失，一般不需要停药，出现上述情况多是由于痔粘膜表面糜烂造成的，多次用药后局部烧灼感会减轻并逐渐消失。