赤芍的保存需严格遵循密封、阴凉避光的原则，以维持其药效和品质。
1、密封：赤芍易吸湿变质及遭受虫害，必须采用密封容器进行物理隔绝。推荐使用密封玻璃罐、陶瓷罐，或使用加厚密封袋进行包装。这能有效防止药材吸收空气中的水分而变软发霉，同时阻断虫卵侵入或成虫污染，是保存的基础。
2、阴凉避光：密封后的赤芍应存放于阴凉、干燥、通风的避光环境中，如橱柜或抽屉内。务必远离厨房、浴室等湿热源，并严禁阳光直射。阴凉避光的环境能减缓赤芍中有效成分的降解和氧化，防止药材变色或药效丧失。
需要提醒的是，在保存期间应定期检查赤芍的状态。一旦发现药材出现受潮发软、霉斑、虫蛀或产生任何异味，即表明品质已发生变化，应立即丢弃，不可继续使用。