黄芪和黄芩不一样，二者的来源、性味归经、功效和主治完全不同。
1、来源不同：黄芪是一种补气类中药材，为豆科植物蒙古黄芪或膜荚黄芪的干燥根；黄芩是一种清热燥湿类中药材，为唇形科植物黄芩的干燥根。
2、性味归经不同：黄芪味甘，性微温，归肺、脾经；黄芩味苦，性寒，归肺、胆、脾、大肠、小肠经。
2、功效不同：黄芪具有补气升阳、固表止汗、利水消肿、生津养血、行滞通痹、托毒排脓、敛疮生肌的功效；黄芩具有清热燥湿、泻火解毒、止血、安胎的功效。
4、主治不同：黄芪常用于治疗气虚乏力、食少便溏、中气下陷、久泻脱肛、便血崩漏、表虚自汗、气虚水肿、内热消渴、血虚萎黄、半身不遂、痹痛麻木、痈疽难溃、久溃不敛等病症；黄芩常用于治疗湿温、暑湿所致的胸脘痞闷、恶心呕吐，大肠湿热所致的泄泻痢疾、黄疸，肺热壅遏、肺失清降所致的咳嗽痰稠，外感热病、中上焦郁热所致的高热烦渴，血热妄行所致的吐血、衄血、崩漏，热扰胞宫所致的胎动不安，以及火毒炽盛所致的疮痈肿毒、咽喉肿痛。
需要提醒的是，黄芪和黄芩的药性与主治方向完全相反，需在专业中医师的辨证指导下使用，切勿因名称相近而混淆误用，以免加重病情或引发不适。