菖蒲是有香味的，且不同种类的香味在浓度、特点上差异明显，这与其含有的挥发油成分密切相关，香味也会影响其用途（如药用、观赏、香料）。
从药用菖蒲来看，石菖蒲的香味较突出，其根茎和叶片均带有清新的芳香，气味温和且持久，这也是它能用于安神助眠（如泡澡、泡脚时借香气舒缓神经）、入药（挥发油是药效成分之一）的重要原因；水菖蒲同样有香味，但气味更浓烈，甚至略带刺激性，且因含毒性成分，其香味虽能用于制作香料（需处理），却不能像石菖蒲那样直接用于药用保健场景。
从观赏菖蒲来看，金钱蒲、虎须菖蒲等品种也有香味，不过气味相对清淡，多为淡淡的草木香，主要在叶片揉搓或靠近时能闻到，这种淡雅的香味让它们更适合作为盆栽观赏，为室内增添自然气息，药用价值较低，香味也不用于药效发挥。
综上，菖蒲普遍有香味，石菖蒲香气温和可辅助药用，水菖蒲香味浓烈带刺激性且有毒，观赏菖蒲香味清淡供赏玩，可根据香味特点和自身需求选择对应的菖蒲品种。