黄芩和黄芪的区别主要在于来源不同、性味归经不同、功效主治不同等。
1、来源不同：黄芩为唇形科植物黄芩的干燥根；黄芪则为豆科植物蒙古黄芪或膜荚黄芪的干燥根。
2、性味归经不同：黄芩味苦，性寒，归肺、胆、脾、大肠、小肠经；黄芪则味甘，性微温，归肺、脾经。
3、功效主治不同：黄芩具有清热燥湿、泻火解毒、止血、安胎的功效，适用于湿温暑湿、胸闷呕恶，湿热痞满、泻痢、黄疸，肺热咳嗽、高热烦渴，痈肿疮毒，血热出血，胎热胎动不安；黄芪则补气升阳、固表止汗、利水消肿、生津养血、行滞通痹、托毒排脓、敛疮生肌，适用于气虚乏力、食少便溏、中气下陷、久泻脱肛、便血崩漏，表虚自汗，气虚水肿，血虚萎黄，半身不遂，痹痛麻木，痈疽难溃，久溃不敛等。
总之，黄芩和黄芪属于两种不同的药物，前者侧重于“清”，适用于实证；后者侧重于“补”，适用于虚证。如果有用药需求，需在专业中医师指导下选用，以确保用药安全和有效。